APLICACIÓN DE SECUENCIACIÓN MASIVA PARA EL ESTUDIO Y EXPLORACIÓN DE DIVERSIDAD MICROBIANA Y SU APROVECHAMIENTO BIOTECNOLÓGICO

Resumen

Se describe brevemente las metodologías más importantes de la metagenómica como técnica alternativa a métodos clásicos de cultivo para el estudio de microorganismos. Cerca de 99% de los microorganismos no pueden ser cultivados fácilmente, por ello se ha registrado un aumento en el uso de tecnologías que ofrecen respuestas rápidas, económicas y de mayor precisión sobre la información de genomas. Una de estas tecnologías es la secuenciación de próxima generación (NGS) ubicada como herramienta emergente para estudiar comunidades de microorganismos no-cultivables; por su capacidad de obtener grandes volúmenes de datos de secuencia, con lo cual aumenta la accesibilidad de los recursos genéticos contenidos, por ejemplo en un suelo. Estudios con plataformas de NGS en ácidos nucleicos extraídos de rizósfera proveen un amplio espectro de los microorganismos que la habitan, además de obtener y amplificar fragmentos a partir del DNA genómico de la comunidad y ser analizados por técnicas cultivo-independientes, capaces de mostrar la influencia de la planta sobre la estructura de la comunidad microbiana y deducir que la composición de la microbiota bacteriana en la rizósfera se ve afectada por un complejo de interacción entre el tipo de suelo, la especie hospedera y circundantes y la localización de la raíz de la planta hospedera.